1959 г. - создан новый Московский театр миниатюр, труппа выступала в Центральном доме культуры железнодорожников
1962 г. - переехал в Тверской район, получив здание старого театра "Эрмитаж" (существовал до 1918 г.) в саду "Эрмитаж"
Художественный руководитель В. Пашков привлёк к работе 12 молодых актёров. В постановках участвовали, в том числе, и приглашённые режиссёры: Андрей Гончаров, Юрий Любимов. Давид Тункель.
В этом театре с постановкой миниатюры Бориса Ласкина "Благородный поступок" состоялся режиссёрский дебют Марка Захарова.
В 1961-1968-м должность худрука занимал режиссёр Владимир Поляков, при котором в театре, наряду с обычными эстрадными миниатюрами[ начался показ "больших" спектаклей.
В 1978 году был осуществлён ремонт интерьеров театра. Наиболее примечательным новшеством стали фарфоровые люстры, выполненные по эскизам художника Н. Бровченко.
В 1978 году в театре начал работать молодой режиссёр Михаил Левитин. В первую очередь, благодаря его деятельности театр трансформировался из эстрадного в драматический.
Его первой крупной работой стал в 1981 году спектакль "Чехонте в Эрмитаже". Левитин первым в Советском Союзе представил публике спектакли по произведениям обэриутов: Даниила Хармса, Александра Введенского и Николая Олейникова. В 1982-м состоялась премьера "Хармс! Чармс! Шардам! или Школа клоунов", ставшего знаковым для истории театра. За последующие годы спектакль "Хармс!.." был представлен более 700 раз.
В 1987-м Левитин становится главным режиссёром, и при его непосредственном участии театр был переименован в "Эрмитаж".
В 1990-м Левитин занимает должность художественного руководителя.
В 2000-х "Эрмитаж" окончательно сформировался как авторский театр, где проходят уникальные для Москвы постановки. В списке оригинальных спектаклей: "Нищий, или Смерть Зандаo", основанный на неоконченной пьесе Юрия Олеши, "Капнист туда и обратно", в котором объединилось творчество современного драматурга Юлия Кима и писателя XVIII века Василия Капниста, "Ивона, принцесса Бургундская" по одноимённой пьесе польского авангардиста Витольда Гомбровича. Пьесы для нескольких спектаклей написал Левитин: "Анатомический театр инженера Евно Азефа", "Тайные записки тайного советника", "Изверг", "Снимок Бога"[2]. Для нескольких постановок музыку написали Альфред Шнитке и Владимир Дашкевич. Декорации создавали, в том числе, известные художники Борис Мессерер и Гарри Гуммель
В апреле 2011 года государственная экспертиза признала, что здание театра находится в аварийном состоянии. Несущие конструкции большого зала были перегружены на 30 %, из-за чего они провисли на полметра. Труппу попросили немедленно освободить помещения. Худрук Михаил Левитин заявил, что у театра нет второй сцены для выступлений, после чего столичный Департамент культуры предложил 12 площадок, на которых разрешалось временно давать спектакли. В мае того же года московские власти объявили о решении потратить на реставрацию здания 266 млн руб. В октябре 2014 года был проведён новый тендер на проведение ремонтных работ, общая стоимость которых составила 537 млн руб. Подрядчик обязывался провести реставрацию интерьеров и фасадов, создать инфраструктуру, соответствующую современным требованиям комфорта, проложить новые инженерные сети и благоустроить окружающую территорию. Согласно условиям контракта, все работы планировалось завершить к 31 декабря 2016 года
С декабря 2015 года основная площадка театра — помещение на Новом Арбате (дом 11).
29 марта 2022 г - в соответствии с приказом Департамента культуры города Москвы к театру присоединён театр "Сфера".
