Сергей Сергеевич Митрохин родился 20 мая 1963 года в Москве в семье инженера. Русский
Отец - Сергей Митрохин, инженер НПО "Энергия", г. Королёв
Мать - инженер завода "Сатурн", Москва
1985 г. - окончил филологический факультет Московского государственного педагогического института им. В.И. Ленина (ныне - Московский государственный педагогический университет)
1986-1987 гг. - диспетчер Московского городского бюро путешествий и экскурсий
1987-1988 гг. - инженером в Центре содействия творческой инициативе "Сотрудничество"
1987 г. - член клуба "Перестройка", с декабря 1987 по 1989 год — группы "Перестройка-88".
С мая 1988 по 1989 год входил в редколлегию одной из первых в перестроечной России самиздатской газеты "Хронограф, постоянный её автор
В мае-июне 1988 года участвовал в создании неформального исследовательского центра "Московское общественное Бюро информационного обмена" (М-БИО), на основе которого в конце 1990 года был учрежден Институт гуманитарных и политических исследований.
1992—1995 гг. - заместитель директора Института гуманитарных и политических исследований
С осени 1988 по 1990 год — сотрудник социологического подразделения кооператива "Перспектива".
С декабря 1989 года — одновременно сотрудник Института социологии.
В 1990—1993 годах учился в аспирантуре Института социологии РАН,
В 1992 году окончил Высшие социологические курсы при Советской социологической ассоциации
В 1993-2003 годах — депутат Государственной думы первого, второго и третьего созывов от "Яблока"
В 2001—2008 годах — заместитель председателя партии "Яблоко".
В 2004 году основал общественный комитет — "Комитет защиты москвичей", став его председателе
С июня 2004 г. - избран руководителем московского отделения "Яблока"
2005-2009 гг. - депутатом Московской городской Думы (по партийным спискам от партии "Яблоко")
В 2008 избран председателем партии "Яблоко".
В июне 2012 года переизбран председателем партии "Яблоко"
2013 г. - на выборах Мэра Москвы, занял четвёртое место, набрал 3,51 %
8 сентября 2019 г. избран депутатом Московской городской Думы VII созыва (2019-2024) по избирательному округу № 43 (Арбат, Пресненский, Хамовники), выдвинут партией "Яблоко", поддержан "Умным голосованием"
Первая жена - Писарева Вера Николаевна, 1969 г.р., политолог, журналист
Вторая жена - Митрохина Наталья Владимировна (в девичестве Краснобаева, с 2005 года), политолог, журналист
Дочь 2002 г.р.
Кандидат политических наук, диссертация на тему "Политологический анализ процесса становления федеративных отношений в России" (2001)
