Вознесенский собор монастыря был усыпальницей женщин княжеского и царского рода, а также монашествующих. Первой в Вознесенском монастыре была погребена его основательница — преподобная Евфросиния. .
В апреле 1929 года по инициативе коменданта Кремля Р. А. Петерсона, правительственная комиссия, в которую входили: К. Е. Ворошилов, В. В. Шмидт, А. С. Енукидзе, осмотрели здания Чудова и Вознесенского монастырей и постановили снести их, очистив место для строительства Военной школы имени ВЦИК.
Предвидя подобный исход событий, Н. Н. Померанцев, стоявший во главе комиссии в составе Д. Н. Сухова, В. К. Клейна, А. В. Орешникова, В. Н. Иванова и других специалистов добился выделения денежных средств и в кратчайшие сроки организовал архитектурные обмеры, фотофиксацию монастырских построек, обследование захоронений великих княгинь и цариц и вывоз белокаменных саркофагов с останками в подземную палату южной пристройки Архангельского собора, где они пребывают и ныне (кроме мощей Евфросинии Московской, которые были перенесены 28 мая 2008 года в придел мученика Уара Архангельского собора).
Известные личности, захороненные в Вознесенском монастыре :
Агафья Семёновна Грушецкая, царица (ум. 1681), первая супруга царя Фёдора Алексеевича
Агафья, княжна (19.V.1516 г.)
Анастасия Владимировна, княжна, дочь князя Владимира Старицкого, 7.I.1568
Анастасия Петровна, княжна (17.XII.1541) — племянница великого князя Василия III Ивановича,
Анастасия Романовна, царица (ум. 1560), первая супруга царя Ивана IV Грозного
Анастасия Юрьевна, княгиня (ум. 1422), супруга князя Юрия Дмитриевича Галицкого.
Анна Алексеевна, царевна (ум. 8.V.1659 г.), дочь царя Алексея Михайловича
Анна Васильевна, царевна (ум. 1609), дочь царя Василия Шуйского
Анна Ивановна Бельская (Вельская), княжна, 17.II.1561 г.
Анна Михайловна, царевна (ум. 1692), дочь царя Михаила Фёдоровича, в схиме Анфиса
Антония (Опухтина), схимонахиня (ум. 11 января 1688)
Евдокия Алексеевна, царевна (ум. 1669), дочь царя Алексея Михайловича
Евдокия Владимировна, княжна, дочь Владимира Старицкого, 20.ХI.1570 г.
Евдокия Дмитриевна, преподобная, православная святая, Великая княгиня (ум. 1407), жена великого князя Дмитрия Донского, в монашестве Евфросиния (мощи пребывают в приделе мученика Уара Архангельского собора)
Евдокия Ивановна, княжна (ум. 1513) — дочь Ивана III
Евдокия Ивановна, царевна (ум. 1558), дочь царя Ивана IV Грозного. Среди безымянных
Евдокия Лукьяновна Стрешнева, царица (ум. 1645), вторая супруга царя Михаила Фёдоровича
Евдокия Михайловна, царевна (ум. 1637), дочь царя Михаила Фёдоровича
Евдокия Романовна Одоевская, княгиня, вторая жена Владимира Старицкого, 9.Х.1569 год.
Евдокия Федоровна Мстиславская, княжна, 7.IV.1600 г.
Евфросиния Полиевктовна, княгиня (ум. 1466), супруга князя Петра Дмитриевича.
Евфросинья Андреевна Старицкая, княгиня, мать Владимира Старицкого, 20.Х.1569 год
Елена Васильевна Глинская, Великая княгиня (ум. 1538), вторая супруга великого князя Василия III
Елена Романовна, княгиня (ум. 1483), супруга князя Андрея Васильевича Большого
Елена Стефановна, княгиня (ум. 1505), супруга сына великого князя Ивана III, кн. Ивана Младого.
Иван Сисеев, князь, ум. 26.IX.1557 г.
Ирина Фёдоровна Годунова, царица (ум. 1604), супруга царя Фёдора Ивановича. Без эпитафии
Иулиания (в постриге - Анастасия), боярыня, монахиня (ум. 1579), мать царицы Анастасии Романовны
Константин Данилович Зьялов, князь (14.XII.1526)
Мария Борисовна,Великая княгиня (ум. 1467), первая супруга великого князя Ивана III
Мария Владимировна Долгорукова, царица (ум. 1625), первая супруга царя Михаила Фёдоровича
Мария Владимировна, княжна, дочь Владимира Старицкого, 9.Х.1569 г.
Мария Ивановна, царевна (ум. 1551), дочь царя Ивана IV Грозного
Мария Ивановна, царевна (ум. 1692), дочь царя Ивана V Алексеевича
Мария Ильинична Милославская, царица (ум. 1669), первая супруга царя Алексея Михайловича
Мария Петровна, царица (ум. 1626), вторая супруга царя Василия Шуйского
Мария Темрюковна, царица (ум. 1569), вторая супруга царя Ивана IV Грозного
Мария Фёдоровна Нагая, царица (ум. 1608), седьмая супруга царя Ивана IV Грозного, в инокинях Марфа
Мария Ярославна, Великая княгиня (ум. 1484), супруга великого князя Василия II Темного, в инокинях Марфа
Марфа Васильевна Собакина, царица (ум. 1571), третья супруга царя Ивана IV Грозного
Марфа Михайловна, царевна (ум. 1632), дочь царя Михаила Фёдоровича
Наталья Алексеевна, царевна (ум. 1728), дочь царевича Алексея Петровича
Наталья Кирилловна Нарышкина, царица (ум. 1694), вторая супруга царя Алексея Михайловича
Параскева Михайловна, царевна (ум. 1622), вторая супруга царевича Ивана Ивановича
Пелагея (Караулова), схимонахиня. IV.1657 г.
Пелагея Михайловна, царевна (ум. 1628), дочь царя Михаила Фёдоровича
Петранида, схимонахиня. 13.III.1696 г.
Прасковья Ивановна, царевна (ум. 1731), дочь царя Ивана V Алексевича
Софья Витовтовна, Великая княгиня (ум. 1453), супруга великого князя Василия I. .
Софья Михайловна, царевна (ум. 1636), дочь царя Михаила Фёдоровича
Софья Палеолог, Великая княгиня (ум. 1503), супруга великого князя Ивана III
Татьяна Владимировна, княжна, дочь князя Владимира Старицкого, 8.I.1564 г.
Татьяна Михайловна, царевна (ум. 1707), дочь царя Михаила Фёдоровича
Фёдор Иванович Вельский (Бельский), княжич, сын князя Ивана Вельского. 18.VI.1568 г.
Фёдор Петрович Салтыков, боярин. 4.II.1696 г.
Фёкла (Салтыкова), игумения, в миру Феврония (ум. 22 февраля 1700 г.)
Феодора Алексеевна, царевна (ум. 1667), дочь царя Алексея Михайловича
Феодора Шнитова, схимонахиня (ум. 25 октября 1700 г.)
Феодосия Ивановна, царевна (ум. 1691), дочь царя Ивана V Алексеевича
Феодосия Фёдоровна, царевна (ум. 1594), дочь царя Фёдора Ивановича